充分发挥国际协同创新、跨学科研究的优势，上海纽约大学围绕城市科学、商业、金融、公共卫生等诸多领域开展研究，力求以科研服务于地方与国家的战略目标。在发挥高校学术辐射作用的同时，积极探索和拓展大学公共服务职能。
放眼中国快速发展的经济趋势，借助校园地理优势，上纽大成立商学教育与研究中心（CBER）、金融波动研究所（VINS），发挥学界与业界间的桥梁作用，以学界视角为商业和金融发展尽己所能、贡献科研力量。上纽大商学部教授们在市场营销、经济学和金融等领域开展创新研究，并将丰富的实践经验和商业敏锐性融入学术和研究活动，探寻中国在全球经济中扮演的角色，为经济发展提供新思路；由纽约大学教授、诺贝尔经济学奖得主Robert Engle教授领军的金融波动研究所旨在推动对中国乃至全球金融市场的实证研究，促进学术界和金融业界在研究领域的合作，并通过金融计量技术创新的平台为学术界、金融业界，以及监管、决策部门提供及时的金融市场信息和分析，推动金融产业及国际金融政策的发展。
2021年9月，上海纽约大学与金融数据港、尼西韦恩数据科技公司签署战略合作协议，在金融科技领域的人才培养、科研创新、国际交流、实习实训、战略咨询等方面正式建立深层次、全方位的战略合作关系，并合作筹建由诺贝尔经济学奖得主Thomas J. Sargent教授主导的张江金融量化研究中心。中心发挥上纽大在数学和计量科学方面的优势，结合地区资源，开展基础和创新应用研究，冲击全球领先高水平科研成果，并服务地区重点发展领域的迫切需求。
上海纽约大学应用社会经济研究中心（CASER）旨在通过严谨的定量分析方法，以跨学科、国际化的视角来研究当今社会经济发展的重要议题。中心汇聚相关领域多个学科的顶尖学者，聚焦人口老龄化与健康、计算社会科学、教育与人类发展、性别与家庭、不平等与贫困、移民、城市社区和治理等重点领域。
2022年5月，上海市城市设计与城市科学重点实验室获批筹建。该实验室为学校首个省部级重点实验室，实现了学校科研创新平台建设的突破。重点实验室研究数字智慧城市的转型，强调城市规划、城市数据科学、城市生态、城市地理等多学科的跨界融合，形成具有创新活力的学术中心和国际前沿的数字城市共享平台。
